聚焦水产种质资源评价与保存，水产遗传育种理论与技术，水产良种培育与扩繁优势特色，研究水产动植物重要经济性状（如生长、抗逆、品质等）的遗传规律及调控机制。研发人工改良水产动植物遗传性状的技术和途径，通过改造水产动植物的遗传结构，从而改变水产动植物表型性状、提高经济性能。开发水产业工程技术，研究水产动植物生殖活动及其调控规律和调控技术，研究制订水产动植物繁殖人工调控技术标准和管理措施，以保证水产动植物健康繁殖、提高繁殖效率。面向经济主战场和国家粮食安全战略，发挥学科方向在棘皮动物、贝类、藻类遗传育种的国际领先优势和产业引领作用，为加快推进国家种业振兴，实现种业科技自立自强、种源自主可控提供支撑。